基因組測序拯救鸮鸚鵡
在新西蘭五個沒有捕食者的島嶼上,大約現(xiàn)存250只鸮鸚鵡 圖片來源:Lydia Uddstrom
為了保護(hù)極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo,幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序,這為其保護(hù)管理提供了重要信息。
【資料圖】
新西蘭鸮鸚鵡kakapo(Strigops habroptila)有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡,有的雄性甚至超過3公斤,被認(rèn)為有達(dá)90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡,通過爬樹或在地上覓食,以此來尋找堅(jiān)果和種子等食物。
這種綠色的鳥類曾經(jīng)在新西蘭廣泛分布,但幾乎被貓和老鼠等捕食者徹底消滅。剩下的個體有250只左右,由新西蘭保護(hù)部與五個無捕食者島嶼上的毛利人團(tuán)體合作管理。
Kakapo種群規(guī)模小,防止近親繁殖具有挑戰(zhàn)性。個別鸮鸚鵡經(jīng)常被轉(zhuǎn)移到不同的島嶼,以增加整體種群的遺傳多樣性,這對適應(yīng)未來的威脅很重要。然而,直到最近,研究人員還很難確定應(yīng)該轉(zhuǎn)移哪些鸮鸚鵡。
為了幫助做出決定,新西蘭奧塔哥大學(xué)的Joseph Guhlin和Peter Dearden及同事對約90%現(xiàn)存鸮鸚鵡的全基因組進(jìn)行了測序。
Guhlin說,保護(hù)部現(xiàn)在正在利用這些信息,根據(jù)基因親緣關(guān)系來決定哪些個體應(yīng)該移至其他島嶼。他說:“這意味著它們可以優(yōu)先進(jìn)行轉(zhuǎn)移,以增加親緣關(guān)系不密切的個體之間交配的機(jī)會。”
該部門還利用這些信息挑選了四個鸚鵡,并于上個月將它們重新移至新西蘭北島,此前它們已離開新西蘭50年。Dearden說,被選中的個體有相當(dāng)標(biāo)準(zhǔn)的基因組,這意味著“它們可以負(fù)擔(dān)重新登陸新西蘭的風(fēng)險,因?yàn)樗鼈儧]有攜帶罕見的變異基因?!?/p>
對鸮鸚鵡的基因組進(jìn)行測序,使研究人員能夠識別出與健康特征相關(guān)的某些遺傳變異,如它們產(chǎn)卵的數(shù)量、幼崽生長速度和疾病易感性。Dearden說,這些信息可能被用來識別具有更高“遺傳價值”的個體,如果需要的話,這些個體可能會在未來用于伴侶配對,或者識別需要更多照顧的弱勢個體。
Guhlin說,通過對種群中所有個體的基因組進(jìn)行測序,特別是在測序成本下降的情況下,可以幫助保護(hù)其他極度瀕危物種。“我們希望這能成為其他保護(hù)行動的藍(lán)圖,”他說。
研究人員在8月28日出版的《自然-生態(tài)與進(jìn)化》上發(fā)表了這一研究成果。
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